SugimuraLab @SugimuraLab
Sugimura lab at the Department of Bioinformatics and Systems Biology, Faculty of Science, The University of Tokyo 東京大学理学部杉村研究室 機械的な力による多細胞秩序形成原理を研究しています koolau.info Tokyo, Japan Joined February 2020-
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Revised manuscript now available on bioRxiv, including new analyses and numerical simulations of cell division progression. biorxiv.org/content/10.648…
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Most beautiful graph I’ve ever plotted: precise control of average cell size emerging from the frequencies and size dynamics of distinct division lineages in Drosophila wing. More on spatiotemporal division dynamics, see: biorxiv.org/content/10.648…
堀田夏生さんが令和7年度理学部学修奨励賞を受賞しました。おめでとうございます！ s.u-tokyo.ac.jp/ja/info/11086/
To actin and adhesion lovers in the Fly community, we’re pleased to announce that a GFP knock-in line for Coronin-1, a WD-repeat actin-binding protein, is now available from the Kyoto Stock Center. Stock: kyotofly.kit.jp/cgi-bin/stocks… Original publication: jstage.jst.go.jp/article/csf/48…
@himagine1975 @uchugawa 40代ですが、ずいぶん前からPaperと呼ばなくなりました。ちなみに、大事な論文は印刷して読みたい派です。
New preprint! Using in vivo data of epithelial development, we demonstrate the compatibility of strain rate tensors and the accuracy of kinematic equations. The results cross-validate the modified texture analysis and our hydrodynamic model. biorxiv.org/content/10.110…
Link to her first first-author paper, Bayesian Parameter Inference for Epithelial Mechanics: linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S…
Xin received the Excellent Research Award based on her master’s thesis. Congratulations! M2の厳欣さんが東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻のExcellent Research Award優秀賞を受賞しました。 cbms.k.u-tokyo.ac.jp/about/award/
Bayesian Force Inference is now on Google colab! Together with GetVertex, an ImageJ/Fiji plugin for extracting input data from skeletonized images, this enables code-free quantification of forces during epithelial development. github.com/Sugimuralab/Ba…
We're now on BlueSky! Follow us at: bsky.app/profile/sugimu…
Happy to share GetVertex, an ImageJ/Fiji plugin that extracts vertex positions and connectivity from skeletonized images. The output text file can be used as input for Bayesian Force Inference and Image-based Parameter Inference for Epithelial Mechanics. github.com/Sugimuralab/Ge…
@HYtane ごめんなさい。私です。教員情報DBの件です。ご対応いただけたので削除しました。
SugimuraLab retweeted
当専攻・生物学科が研究の場としている「理学部２号館」は、築90年。たくさんの卒業生を送り出してきたこの建物が、老朽化により存続の危機を迎えています。これからもこの歴史的な建物を維持し活用するために、基金へのご協力をよろしくお願いいたします。utf.u-tokyo.ac.jp/project/pjt197
Bayesian parameter inference for epithelial mechanics has been published in a topical issue of the Journal of Theoretical Biology, edited by @JochenKursawe and Nikolaos Sfakianakis. This is the first paper by our master’s student, Xin Yan. Congrats, Xin! sciencedirect.com/science/articl…
New preprint! We employed Bayesian statistics to improve the utility and flexibility of image-based parameter inference, a statistical framework to construct functions of Cell Vertex Model and estimate their parameters from image data. biorxiv.org/content/10.110…
@tetsuotani1 Last but not least, we thank the reviewers for their constructive comments and suggestions, which helped us significantly improve this review.
I finally had the chance to work with my respected senpai (先輩) @tetsuotani1. We met at Takeichi Lab when I was an undergraduate, and I learned a lot from him during the writing process.
Happy to see our review on vertex remodeling out! Exciting collaboration with @tetsuotani1. Highlights include EM image of end-on actin filaments attached around the cell vertex and new modeling frameworks to analyze mechanics at the cell vertex. sciencedirect.com/science/articl…
SugimuraLab retweeted
Mechanical forces can affect the way tissue grows. Ideally, we want to characterize them without interfering with the processes we are studying. Is there a way to achieve this? I am @borgesaugust. Welcome to my stress inference tutorial! #EpithelialMechanics
Links to the original papers/preprint: journals.plos.org/ploscompbiol/a… biorxiv.org/content/10.110… sciencedirect.com/science/articl…
We haven’t tweeted about this update yet: the codes for Bayesian force inference and image-based parameter inference have been uploaded to GitHub since 2022. github.com/Sugimuralab github.com/IshiharaLab
Miki Ebisuya @EbisuyaMiki
10K Followers 782 Following Synthetic developmental biologist at PoL TU Dresden. Cross-species comparison and manipulation of organoid zoo.
Honda Naoki @HondaNaoki
3K Followers 3K Following Theoretical biologist, Prof at Nagoya U / Hiroshima U, Japan. Data-driven biology with mathematical modeling & Machine learning. Tweets are my own.
姫岡 優介 @yhimeoka
5K Followers 469 Following システム生物学とかやってます。細胞死に興味があります。東京大学 生物普遍性研究機構 古澤研究室助教/ 学変B『生命−非生命転移』領域代表 / JSTさきがけ未来数理科学 /『システム生物学入門』よろしくお願いします！https://t.co/lil5VWaRCJ tweets are my own
はじめまして �... @HiraokaYasushi
7K Followers 1K Following 科学者（在野）。発言は私個人のものですが世界の中心です。芸風は、刹那的享楽主義楽観的構造学派。見える現象の背後にある、見えない真実を、見える形で表現する。理想とするサイエンスは、より単純にして、より多くのことを、より深く説明できること。
サクセスリバー... @rei_nari
14K Followers 4K Following ミドフォー生物系研究者。漫画読み。邦画好き。高校生双子男女育児中。エイトプリンス勤務。新幹線通勤卒業。テトラピロールラブ。特に環が開いたやつ。ラボのHPはこちら↓ https://t.co/jS3OOmQJsZ これまでの発表論文はこちら↓ https://t.co/NNrs8lJoe0
Nozomu Yachie @nzmyachie
5K Followers 2K Following Professor at the University of British Columbia @UBC and Specially Appointed Professor at the University of Osaka @WPI_PRIMe. UBC教授、阪大特任教授、東大先端研客員教授
Hiroko Bannai🐭🕊 @hiroko_bannai
7K Followers 2K Following Biophysicist and Neurobiologist. Waseda University, Faculty of Advanced Science and Technology, Department of Electrical Engineering and Bioscience, Professor.
Miho Yanagisawa @mh_yanagi
2K Followers 500 Following Associate Prof. at UTokyo, Komaba. / soft matter / biophysics / polymer droplets / microgels / vesicle / membrane
MAEDA Lab, Kyoto U @yusukemanlab
856 Followers 231 Following Kyoto University, Dept. Chemical Engineering. Physicists build something new. 京大前多研のなかのひと。 Bluesky: https://t.co/q1ypbCPkl9
Campàs Lab @CampasLab
6K Followers 669 Following Physics of Embryonic Self-Organization and Morphogenesis. Tweets by Otger Campàs (Professor, Chair of Tissue Dynamics and Director @PoLDresden)
Daiki Nishiguchi @daikinish
3K Followers 1K Following Associate Prof@Dept Phys, Science Tokyo; noneq statphys, active matter, biophys. 東京科学大学 理学院物理学系 准教授; 非平衡統計物理、アクティブマター、生物物理などやってます。
Ohue M/大上雅史 @tonets
14K Followers 3K Following 猫じゃら氏🐈准教授@ohuelab #猫じゃらぼ 𝙎𝘾𝙄𝙀𝙉𝘾𝙀 𝙏𝙊𝙆𝙔𝙊⭐️情報理工学院。Sax、猫、麻雀、ポーカー、学振が趣味。Bio/Cheminfo。10歳&6歳&0歳育児。学振本著者📗📗📗AI for 𝙎𝘾𝙄𝙀𝙉𝘾𝙀！
粟津＠広島_現�... @AwaGensho
502 Followers 208 Following 当研究室では、ゲノムから細胞社会スケールに至る様々な生命現象（基礎生物系〜医療系）を理論・データ解析・実験を通じて研究しています。最近の主な研究対象は「ウニ」「ネコ」「（ネコのモデル生物の）ヒト」です。 ここでは研究室での粟津の周辺の出来事や、研究にまつわる雑感を発信したいと思います。
Shuhei Furukawa Group @FurukawaG_Kyoto
5K Followers 648 Following Porous, soft and biomaterials research at iCeMS @iCeMS_KU_INTL, @iCeMS_KU, Kyoto University.
Hironori Funabiki @HironoriFunabi1
10K Followers 776 Following Mitosis Researcher @RockefellerUniv, New York, NY. Former backstroker. Choir part: bass. Brined turkey & りゅうひ巻き係。https://t.co/7GZl0BSGnT, @hirofunabiki.bsky.soci
Tetsuya J. Kobayashi,... @QbioTetsuya
2K Followers 227 Following Prof.@ Lab. for Q-Bio@Institute of Industrial Science, UTokyo 発言は個人のもので所属組織とは関係ありません Also at https://t.co/FEQuedfJ4r
Haruka Ozaki (尾崎�... @yuifu
4K Followers 4K Following ⊿ Computational biology/Bioinformatics/Research automation. PhD. Tweet in Japanese. 理研と筑波大でバイオインフォと研究自動化のラボを主宰 Lab at RIKEN & Univ. Tsukuba: @ozakilab
iwasakiw @iwasakiw
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吉村 英哲 Hideaki... @Hide_Yshmr
1K Followers 405 Following 生命を作り出す分子の動きを見つけたい/ 顕微鏡･1分子生物学･光･STEAM/ 現所属: 東大院理/ ENG Tweet @h_yoshimura_phd / https://t.co/z9ukcMgwoJ
遠山 祐典 @ToyamaYj
2K Followers 253 Following 主任研究員@メカノバイオロジー研究所。准教授@シンガポール国立大学。🇯🇵(北大) → 🇯🇵(PhD/阪大) → 🇺🇸(ポスドク/Duke) → 🇸🇬(PI)。日本語アカウント。Mechanobiology関連ツイートは @Yusuke_Toyama
原昇吾 @h2LiyIYxWl13987
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Rainin Standard Produ... @R_Standard_JP
146 Followers 998 Following レイニン ピペットとチップ ライフサイエンス 研究開発用✨幅広いユーザー様向けスタンダード商品ご紹介🐶😺🧬研究関連情報も✨先端研究用レイニンのエキスパート商品情報➡️https://t.co/RuAxZWWjlH レイニンメインアカウント 😀 a Mettler Toledo company👍
Nathan N. Evangelista @Evangelista_NN
26 Followers 107 Following Current PhD Student (D2) at Takinoue Lab (Science Tokyo) Unravelling DNA reactions inside biomolecular condensates
Artemy Kolchinsky @artemyte
914 Followers 390 Following Researcher studying nonequilibrium thermodynamics, info theory, origin of life, complexity. Currently at U Pompeu Fabra in Barcelona. @artemyte.bsky.social
Goshi Ogita @GoshiOgita
7 Followers 39 Following ポスドク@LabPHB。生物データと数理モデルをつなぐ統計技術（主にパラメータ推定）を開発しています。松屋と丼丸が最寄り駅にあったらいいなと思っています。
Sindhu @sindhu__16
183 Followers 711 Following Grad student working on the dynamics of epithelial tissues @Medhavishwa lab @BE_IISc | Bits Pilani'21 | Physics X Biology
Eniovip @Eniovip07
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Tatsuo Shibata | 柴�... @TatsuoShibata25
65 Followers 135 Following Biological physicist | theory×experiments on cells & multicellular systems | Team Director, RIKEN BDR | Lab: @LabPHB / 理論×実験で細胞・多細胞の物理生物学（理研BDR）
sekiguti shinichi @sinsin_sekken
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Mike @Mike86584274633
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Yoshiki Kuse @ykh2dezelf
159 Followers 169 Following Development, Human organoid 再生医療や創薬に繋がるヒトオルガノイド研究を推進しています。研究室の情報や個人的に興味のある内容をポスト、リポストしています。研究室HP: https://t.co/K7xTTXgmz9
ぴーちゃん @peechan1970
1K Followers 746 Following NACS-J自然観察指導員。大学では植物病理学をかじりました。生き物に学ぶべきことは本当に多い。特に植物の生きる力に感心。植物関連の研究を知らしめたい。#植物 #植物科学 #植物研究 #plantscience #botanicalscience #plants
酒井裕介. @yusuke_sakai
14K Followers 14K Following 知の冒険に出かけよう。 KagaQ.代表 @KagaQ_Science #科学 #science #technology @ChihiroYamanaka #山中千尋
ちょんきち @1sukeshi1
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◼️INU◼️ @dfeujrai
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CellArchitectureLabor... @CellArching
29 Followers 31 Following National Institute of Genetics, Cell Architecture Laboratory (@KimuraAkatsuki lab)
株式会社GhostDrif... @43fOh15lpj8676
764 Followers 5K Following 意思決定の数理で、日本が誇る高責任領域に停止境界・責任境界・検証可能な証拠ログを実装。AIアシュアランスで責任を証拠化し、産業成長と日本発AIガバナンス標準化を推進。 ▼責任工学技術：ADIC（Lean4検証済） https://t.co/BEyXq9BRql
chenhe li @utopian166
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Katsuhiko Minami @katsu_s_minami
247 Followers 328 Following Post-doctoral fellow at Kleckner Lab @MCB_Harvard
Claud Reinger @CReinger70824
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Ryosuke Kojima @RyosukeKojima4
260 Followers 318 Following Associate Professor at the Graduate School of Medicine, the University of Tokyo
松井 広 / Ko Matsu... @KoMatsui
2K Followers 3K Following 脳と心の本質は、神経細胞だけではない。東北大学 大学院生命科学研究科 超回路脳機能分野 教授・松井広（まついこう）。グリア・血管・末梢神経を含む全身性超回路から心を理解する研究室。心のサイエンスの最前線、共に挑戦する大学院生を募集中 / Professor, Super-network Brain Physiology
Ali Ahsan @AliAhsan514
314 Followers 3K Following PhD student in @CellFunctionLab at Osaka Metropolitan University, Japan. My posts and comments are my own and do not represent my institution.
Sooraj Saini 🇮🇳 @iamSRJ222
232 Followers 2K Following PhD @ IIT Mandi | Organelle stress, adaptation and inter-organelle crosstalk🧬 | Living between pixels & possibilities 🔬.
Promit @promitmoitra
585 Followers 4K Following Exhausted first batch millennial. Dynamics on and of networks. PhD @IiserMohali. Postdoc at Institute for Plasma Research, Gandhinagar.
Pramit Kumar Datta @Pramit17o
27 Followers 728 Following
ち @cfKzCoqYgV98945
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赤宮 真🎓️⛩�... @_akamiya_Lab
3K Followers 7K Following 京大卒×大学教員・研究者×Vtuber アカデミアの面白さをもっと身近に。『貴方の隣のアカデミア』赤宮 真です。 イラスト＆モデルはW＆LWork Shop様 @wl_work_shop_jp 質問はコチラ→ https://t.co/ewx1njrNLu
Iqra Javed @IqraJaved98
7 Followers 204 Following "Passionate about biosciences & informatics | Goal: study abroad and contribute to global research" "Science is my passport — just waiting for the stamp"
Saubashya Sur, PhD @SaubashyaSur
793 Followers 3K Following Assistant Professor@Ramananda College, Bankura University; Expertise in Bioinformatics # Former Postdoc @liu_universitet @FU_Berlin @UmeaUniversity; Shutterbug
dinisterm @dinisterm
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Takashi Nishina @nishina_takashi
2K Followers 3K Following Researcher #Tumor, #Immunology, #Fibroblasts, #Intestine, #Inflammation, #CAFs Toho University, Views are my own. In bluesky, @takashi-nishina.bsky.social
Kyohei Arita @KyoheiArita
689 Followers 720 Following Professor at Tokushima University Structural biology of epigenetics and chromatin regulation.
Bailey Williams @BaileyWill5002
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Akane Kawaguchi @hoyako
398 Followers 625 Following あくまで個人の意見ですので、いいねは備忘録の意味しかないことも多々あります。bluesky@hoyako
Chloe Johnson @ChloeJohns92216
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Samantha Brown @Samanth86127813
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Asano Ishikawa @AsanoIshikawa
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Pain & itch research ... @PainItch_UT
175 Followers 484 Following 富山大・薬・応用薬理（痛み痒みグループ）のアカウントです！！ 様々な疾患による痛み、痒み、痺れの苦痛からの解放を目指して研究しています！ 研究手技・研究成果・イベント（飲み会など）など発信したいと思います！ 興味を持たれた方、一緒に研究してみたい方、共同研究（企業・大学問わず）などお気軽にDM＆フォローお願いします！
がんのすけ @gannosuke0655
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Keiichi Morita @keyM_ecoevo
235 Followers 639 Following Posdoc, Hokkaido Univ. - Posdoc, RIKEN - Ph.D student, SOKENDAI - Master student, Univ. Tokyo/ mathematical modelling in ecology and evolution/ Bassoon
いんそうさん @insou
7K Followers 4K Following ◆駆け出し統計学者◆国立大准教授+国立研究所TD◆旅行とか好き◆娘たちかわいい◆仙台生まれ・東京在住◆KS→UT→ISM→UT+RIKEN◆ 研究室アカウントはこちら→ @imalab_org
Miki Ebisuya @EbisuyaMiki
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Honda Naoki @HondaNaoki
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Prof. Keiko Torii @KeikoUTorii
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姫岡 優介 @yhimeoka
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はじめまして �... @HiraokaYasushi
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Hiroko Bannai🐭🕊 @hiroko_bannai
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Miho Yanagisawa @mh_yanagi
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TLecuitLab @LecuitLab
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Ohue M/大上雅史 @tonets
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eLife - the journal @eLife
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Hironori Funabiki @HironoriFunabi1
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Tetsuya J. Kobayashi,... @QbioTetsuya
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Haruka Ozaki (尾崎�... @yuifu
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TBS NEWS DIG Powered ... @tbsnewsdig
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Tatsuo Shibata | 柴�... @TatsuoShibata25
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Aissam Ikmi @AissamIkmi
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赤宮 真🎓️⛩�... @_akamiya_Lab
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Inada Lab @inada_lab
45 Followers 37 Following 東京大学医科学研究所 総合研究棟1階 RNA制御学分野 学生が運営しています Welcome to inada lab official X!!
maz @dynamicsoar
2K Followers 1K Following studying biomechanics on the life in moving fluids (tweets mostly in Japanese); 生き物にまつわる外部流れを研究しています。昆虫と鳥の飛翔がメインでしたが、植物も始めました。
CellArchitectureLabor... @CellArching
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東京大学教養学... @UTNotify
2K Followers 4 Following 【非公式】東京大学教養学部(前期課程)のHPのお知らせを自動で投稿します。5分おきに更新情報を確認しています。履修登録・成績発表のほか、重要な手続きを見逃さない！#春から東大（since 2024.02.24）
Teruaki Enoto | 榎�... @teru_enoto
6K Followers 4K Following 宇宙物理学(京大/理研)-シチズンサイエンスで雷の謎に挑む雷雲プロジェクト⚡️キューブサット衛星NinjaSatでＸ線天文学🛰宇宙線で月の水探しと月面天文台🌝 時間軸天文台クロノス🚀X-ray astronomer / Citizen science / Collective power of science!
Ryosuke Kojima @RyosukeKojima4
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松井 広 / Ko Matsu... @KoMatsui
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Kyohei Arita @KyoheiArita
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Irene Miguel-Aliaga @FlyGutLab
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Hiromi Matsumae @hmat_evo
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Iswar Hariharan, ई�... @HariharanLab
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Kei Hiruma (晝間敬... @HirumaKei
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Takeshi Kawasaki @takeshi_kwsk
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Kazufumi HOSODA @HosodaKazufumi
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学術変革領域研... @EpicAssemblyJp
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Daniel Packwood @d47582_daniel
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NAKAGAWA Naoko @NAKAGAWANaoko1
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Physics of Life Dresd... @PoLDresden
4K Followers 91 Following We are the Cluster of Excellence Physics of Life @tudresden_de @DFG_public. Our goal is to unravel the principles underlying the organization of living matter.
The Knoblich Lab @Knoblich_lab
4K Followers 48 Following Research group @IMBA_Vienna and the @viennabiocenter.
Bipasha Dey @bipashadey29
106 Followers 257 Following Developmental biologist interested in mechanics of morphogenesis. Postdoc @yuchiunwang Lab @BDR_RIKEN. PhD @IISERPune. Views are my own.
Alfonso Martinez Aria... @AMartinezArias
9K Followers 903 Following Born and bred in Madrid, brewed in Chicago and Cambridge. Curious about how cells build embryos #NotIntheGenes #InNumbersWeTrust
Koganebuchi, Kae /小... @kae_koganebuchi
224 Followers 303 Following Assistant Professor at UTokyo working with Anthropology, Genomics, Ancient DNA, and East Asian history. 人類学やゲノム学の手法を使って地域の特色を調べる研究者 https://t.co/dF3YNX905x
Akatsuki Kimura @KimuraAkatsuki
35 Followers 64 Following Professor, Cell Architecture Lab (@CellArching), National Institute of Genetics (@NIG_idenken). wants to know how cells are constructed
Eric Theveneau @EricTheveneau
898 Followers 676 Following Principal Investigator at @CbiToulouse, @CNRS since 2013 FRM Amorçage (@FRM_officiel) and @Occitanie PhD @Sorbonne_Univ_ Post-doc @ucl #neuralcrest #emt
Takehiro Tottori @takehirotottori
57 Followers 99 Following RIKEN CBS SPDR / Systems Biology, Theoretical Biology, Stochastic Optimal Control Theory, Bayesian Filtering Theory
Yuika Ueda @yuika_resea
574 Followers 534 Following 🇬🇧UCL Visiting phd student/Osaka University/PhD student/ACT-X,DC1/Mechanobiology,Cellur adaptability/阪大修士→商社→退職D
Stramer Lab @stramerlab
685 Followers 284 Following Cell migration | Extracellular Matrix | Image Analysis @KingsCollegeLon @[email protected]
@juliaeckert.bsky.soc... @JuliaEckert10
614 Followers 522 Following Postdoc at the Yap Lab @IMBatUQ - PhD @LeidenPhysics | Co-organizer @EpiMechFC | Mechanobiology - Cell & Tissue Mechanics - Soft Matter - Image Analysis
Yuma Cho @umeboshisanko
66 Followers 270 Following Assistant professor interested in cell-cell adhesions Kyushu university, Japan
Makoto Suzuki @mako_bio
173 Followers 239 Following Assoc. Prof. at ARC, Hiroshima Univ. Developmental biologist studying #morphogenesis and #NTDs using #xenopus and #zebrafish.
Blankenship Lab @blankenship_lab
649 Followers 549 Following Twitter account for the Blankenship lab @UofDenver — we study epithelial cell shapes and movements in the early fly embryo
Satoshi Toda/戸田 �... @SatoshiTodaLab
125 Followers 95 Following Trying to synthesize cell funstions by design. Synthetic biology@Institute for Protein Research, Osaka UniversityYou might like
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